经过一夜的休整，李墨一行人也开始朝着世界树进发了。
“愿波导可以保护他们一行人。”
艾琳女王也在城中为他们祈祷。
一路上，众人也讨论起了波导。
在吃午饭的间隙中，他们遇到了爱哭树，也从中看到了路卡利欧那温柔的一面。途中他们又经过了一处温泉。
那里也是李墨，利欧路和亚朗，路卡利欧他们曾一起泡过的地方。
李墨和利欧路也不禁想起了那段艰苦的训练。
与此同时，路卡利欧也是一样。他们彼此互相望了望。
路卡利欧也意识到李墨就是小墨，想起他曾经说过的话。
内心也有了一些怀疑。亚朗并不是抛弃了他。
而是为了这座城而牺牲了自己。
就这样来到了夜晚。
大家围坐在篝火旁。
小智也说起了他和皮卡丘最开始的相遇。而他们这些事迹也让路卡利欧又想到了亚朗。
李墨来到了路卡利欧的身旁，向他提议到，再来训一次如何？
路卡利欧看着他。欣然答应。于是三人便走向了森林。
第二天早晨他们便来到了世界树的入口。
而雷吉洛克也在此时出现并阻止了他们。经过激烈的战斗，有惊无险的进入了其中。
他们穿过山洞。遇到了雷吉艾斯。不得已，只能被迫退回山洞。
期间又遇到了火箭队，随后又被雷吉奇鲁斯和雷吉洛克追赶。
眼见不是办法。李墨站出来，打算和利欧路一起将他们引开。
而小智和路卡利欧也选择留了下来一起面对。
另一边的大家却被吞噬了。
在逃跑途中。也意外的与皮卡丘和琪朵小姐相遇了。
李墨一行人来到了出口，却又被三神柱给包围起来了。
随后李墨等人也被吞噬了。
皮卡丘它们愣在原地，泪水止不住的流下来。
而利欧路看到了这一幕，也流下了泪水。也在一瞬间耀眼的白光笼罩了它的身体。
随着身形的不断变大，利欧路进化成了路卡利欧。
梦幻看着这一幕，选择了将他们解放出来。三神柱也随之离开。而它自己也因虚弱而瘫倒在地。
整个世界之树也开始崩坏。
李墨他们跟随着梦幻来到了初始之树的心脏地带。
在这里他们发现了失踪已久的亚朗。透过时间之花，他们也了解到了当时的情况。亚朗通过自己的牺牲来拯救了战乱。
此时，梦幻向着路卡利欧请求着。
“你希望我可以为了这棵树奉献出我的力量吗？好，我愿意”
“等一下路卡利欧如果在这里使用波导的力量的话，你就会跟亚朗走上一样的命运。”琪朵小姐阻止道。
这时李墨也站了出来。和他一起的还有刚刚进化的路卡利欧。
李墨捡起了老师亚朗的手套。
“加上我们的力量，说不定就不需要牺牲了。”
说着也一起释放了波导之力。
“不行，小墨，如果你们要做的话，连你们也会。”小智喊道。
“曾经我因弱小而逃离，现在我也想拼一下。我也想为了这个世界而努力。我也想做出一番成就。”小墨坚定地说道。
在输送力量的最后一刻。路卡利欧挤开了他们。
他们成功了，但路卡利欧也正在消失。
路卡利欧踉踉跄跄的坐在一旁，不经意间又触发了时间之花。
出现的，正是亚朗在即将消失前的画面。还有他所说的一段话。
“路卡利欧，真是对不起。我只能把你封印起来。不这么做的话，不管我去什么地方，你都会跟着我。也会跟我走进相同的命运，无谓的战争跟无谓的牺牲生命。我一个人就足够了。我并没有任何悔恨。路卡利欧，跟你在一起的日子我都觉得非常的快乐。还有小墨，真希望能看到你成功的那一天啊，真希望再跟你们见一次面，我的朋友们。”
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